短导入的 RNA-seq 只不过不错计算已表述的转录本，但无发可以提供以下转录本的形式内容。

如今的，斯坦福学校研究探讨考生在《必然-生态学水平》（Nature Biotechnology）杂志期刊报送告称，这些 的开发出了一大种能留存转录本组成信息的新工艺，这些 确认环状 cDNA 范本和长读取硬盘测序，完成了对转录异构体（transcript isoform）的参考值和浅析。在仅仅研究方案中，实验家放弃了中国传统的短调用 RNA 测序法，运用 PacBio 工司保证的长调用枝术来测序完整性的转录本。孩子 在 20 人体集体的融合样板中，监定取得了 476,000 个转录本字段，一般直径 1 kb。绝很多部分喂奶昆虫的遗传什么是基因遗传，不一致合二为一遗传什么是基因遗传一转录本的传统模式。这种遗传什么是基因遗传常常情况多类复制粘贴手段，具备可变气门正时的转录开始/中断位点。短导入的测序技木不可能具备这些资讯，示例讲，短导入就能够的检测到情况考虑性复制粘贴的外显子，但尚未决定外显子中的框架的关系，是一般包括在相同的个转录本中或者是各有独自展现。理论知识上，长显示测序技术应用可解决那样的限制。探究分析成员共建了由环状cDNA样例结构的SMRTbell文库，并将其使用在测序。由测序游戏平台的显示直径实际效果上比等等 cDNA 长，该设备可对每一个碱基显示多少次，正沿矩形迅速对其进行，转化更加的“环化一直字段”（circular-consensus sequence CCS）。在一项探究分析中，大概显示直径提升 7 kb，绝大部分部分 cDNA 碱基被测序了 5-15 次。分析工人检验的的绝大多都绝许多是主跨转录本，但也并不*。他是是因为 PacBio 测序读长和 cDNA 合成图片速度的制约，而这二个条件都受字段大小的不良影响。开题报告的其主要小说家 Michael Snyder 说明：““对 1.5 kb 以上的 cDNA 我认为没那些难题，而言大区域2-2.5 kb的cDNA我认为，也应该检测到起点终点，”小说家写到。“更长的转录本必须 参照，安全性能较低但更长的导入数据资料。”总的我认为，研究分析工作员提升了 476,000 个CCS，带表着 476 million 碱基。探索人员管理将一些转录本，与 GENCODE 楼盘签定的 mRNA 采取核对，设定了约 14,000 个长约的转录异构体（是指打码和非打码的转录本），这之中有10%是前所末见的。Snyder 表示法：“这些探索就生活就像是智障人士摸象，我们观察到了更齐全的画像。”这方面探究中的技巧可以用做 RNA 的组成部分分析一下和参考值。但是，荷兰专业家 Roderic Guigo （未参入该探究）认定，简单从常见性和实惠性顾虑，哪一技巧重要可用在做一方面，正因为在完美样本量中为各转录异构体记数是很值钱的。麻省工院技术学院的 Chris Burge 教学（未参与性该探索）评价语道：“该的方法极可能在转录异构体技术水平全方面参考文献标注遗传基因组，阐明转录本的全面的结构短信。”此研究方案也可以益处员工改善很多转录本薄弱环节，举个例子理解相隔很远的首选性外显子拷贝什么情况下间接相关。然而 Burge 也认为，不少人类历史转录本实践上低于 2 kb，此科技还迫切需要进那步改进方案，以处里更长回文序列。